Στο μέλλον, η WGS θα είναι η προτιμώμενη μέθοδος για τη διερεύνηση της μικροβιολογικής ασφάλειας των τροφίμων, λόγω της υψηλής διακριτικής της ισχύος και της σταδιακής κατάργησης παλαιότερων μεθόδων οροτυποποίησης διεθνώς.
Το νέο αυτό εργαλείο στοχεύει στην ενημέρωση όλων, και των επιστημόνων τροφίμων αλλά και του απλού καταναλωτή, σχετικά με τις τροφιμογενείς επιδημίες, τους αιτιολογικούς παράγοντες τους και τα εμπλεκόμενα τρόφιμα που λειτουργούν ως "οχήματα" μετάδοσης
Η Λιστερίωση και οι λοιμώξεις από τον ιό του Δυτικού Νείλου ήταν οι ασθένειες με τα υψηλότερα ποσοστά θνησιμότητας και νοσηλείας . Οι περισσότερες τοπικά αποκτηθείσες ανθρώπινες λοιμώξεις του ιού του Δυτικού Νείλου αναφέρθηκαν στην Ελλάδα με 143 κρούσματα
Πολλές τροφιμογενείς εστίες έχουν συσχετιστεί με το ταχίνι. Έχει εμπλακεί σε ανακλήσεις που αφορούσαν κυρίως την παρουσία Salmonella, αλλά κατά καιρούς έχουν εντοπιστεί επίσης Listeria monocytogenes, Coliforms και E.coli