Πώς θα ξεχωρίσουμε τα βρώσιμα φυτά από τα δηλητηριώδη, εύκολα και απλά; Η καινοτομία Plant.ID έρχεται να βοηθήσει ακριβώς σε αυτό.
Τα φυτά είναι ένας κρίσιμος πόρος για τον πλανήτη μας, αφού αποτελεί την πηγή για τρόφιμα, φάρμακα και δομικά υλικά. Εκτός αυτού όμως, μπορούν επίσης να μας επηρεάσουν αρνητικά, όπως συμβαίνει με τα δηλητηριώδη φυτά και τις αλλεργίες λόγω γύρης, μεταξύ άλλων.
Συνεπώς, η δυνατότητα αναγνώρισης των φυτών είναι σημαντική. Η διαδικασία για κάτι τέτοιο δεν είναι πάντα απλή. Η αντιμετώπιση των προκλήσεων του προσδιορισμού των φυτών ήταν ο στόχος του χρηματοδοτούμενου από την ΕΕ έργου Plant.ID, με την υποστήριξη του προγράμματος δράσεων Marie Skłodowska-Curie.
Το Plant.ID είναι ένα συνεργατικό δίκτυο στην Ευρώπη, το οποίο συγκέντρωσε ακαδημαϊκούς και μη ακαδημαϊκούς εταίρους για την ανάπτυξη νέων και κλιμακωτών μεθόδων ταυτοποίησης των φυτών με βάση το DNA.
Ο Hugo de Boer, συντονιστής του έργου, σημειώνει χαρακτηριστικά σύμφωνα με το CORDIS πως: “Αυτό μπορεί να ακούγεται σαν να πυροβολείς μύγα με κανόνι, αλλά το DNA παρέχει ισχυρούς και απλοποιημένους τρόπους αναγνώρισης των φυτών”.
Το έργο υποστήριξε επίσης την εξέλιξη της σταδιοδρομίας και την κατάρτιση της επόμενης γενιάς ερευνητών που θα αναπτύξουν αυτές τις πρωτοποριακές λύσεις για την ταυτοποίηση των φυτών.
Περιγραφή και αξιολόγηση της ποικιλομορφίας των φυτών
Για την επίτευξη του γενικού στόχου, το έργο διαρθρώθηκε σε τέσσερα πακέτα εργασίας.
Η πρώτη εξέτασε τον ορισμό των ειδών ως ταξινομικών οντοτήτων ως βασική προϋπόθεση για τον προσδιορισμό των ειδών από το DNA. Η δεύτερη και η τρίτη δέσμη μέτρων εργασίας επικεντρώθηκαν σε συγκεκριμένες προσεγγίσεις για την ταυτοποίηση βάσει DNA. Η τέταρτη εξέτασε τις πρακτικές εφαρμογές ταυτοποίησης των φυτών με βάση το DNA.
Για παράδειγμα, στη δέσμη εργασίας 1, οι θεωρητικές και πειραματικές εξελίξεις στο DNA μαζικής αλληλουχίας έχουν δοκιμαστεί με τη χρήση ειδών Arctic Silene. Αυτή η εργασία μπορεί να βοηθήσει στην παροχή υποκείμενων πληροφοριών για μια ενημερωμένη ταξινομία της ομάδας. Στη δέσμη εργασίας δύο, οι ερευνητές πρώιμου σταδίου εργάστηκαν για την ανάπτυξη και τη δοκιμή νέων προσεγγίσεων στην αξιολόγηση της μοριακής ποικιλομορφίας των φυτών που προχωρούν πέρα από την αλληλουχία με βάση το amplicon.
Οι μέθοδοι αυτές επιτρέπουν τον ακριβή προσδιορισμό καθώς και τον σχετικό ποσοτικό προσδιορισμό των φυτικών ειδών στα υποστρώματα, ενώ επίσης ενισχύουν την ικανότητα ελέγχου, αυθεντικότητας και παρακολούθησης τέτοιων υποστρωμάτων.
Στο πακέτο εργασίας τρία, αναπτύχθηκαν νέες γενετικές και μοριακές προσεγγίσεις για την ταυτοποίηση των φυτών. Ενώ στο πακέτο εργασίας τέσσερα, ο στόχος ήταν να αναπτυχθούν λύσεις για την παρουσίαση ερευνητικών αποτελεσμάτων που είναι εύκολο για τους τελικούς χρήστες να ερμηνεύσουν.
Τι ακολουθεί για το Plant.ID;
Ο de Boer δηλώνει πως το έργο συγκέντρωσε μια οργανωμένη ομάδα επιστημόνων σε ένα ισχυρό συνεργατικό δίκτυο. Υπάρχουν ακόμα πολλά που πρέπει να γίνουν στον τομέα της μοριακής ταυτοποίησης των φυτών, αλλά το δίκτυο μπορεί να αξιοποιήσει τα επιτεύγματά του χτίζοντας σταδιακά πάνω στα καινοτόμα θεμέλια που έχει θέσει. Παράλληλα, υπογραμμίζει πως εντόπισε πρόσθετα κενά και προκλήσεις που διερευνώνται.
