Μελέτη του Πανεπιστημίου της Πενσυλβάνια αποκαλύπτει σπάνιους γονότυπους και αναδεικνύει την ανάγκη για πιο ευαίσθητες μεθόδους επιτήρησης
Νέα έρευνα από το Πανεπιστήμιο της Πενσυλβάνια δείχνει ότι η παρουσία του βακτηρίου Campylobacter στο κοτόπουλο που διατίθεται στο λιανικό εμπόριο είναι ιδιαίτερα χαμηλή. Ωστόσο, οι επιστήμονες εντόπισαν στελέχη Campylobacter jejuni που δεν αντιστοιχούν στους γνωστούς γονότυπους των πουλερικών, γεγονός που υποδεικνύει ότι οι υπάρχουσες βάσεις δεδομένων δεν αντικατοπτρίζουν πλήρως τη γενετική ποικιλότητα του παθογόνου.
ΔΕΙΤΕ ΕΠΙΣΗΣ | Κόπωση που δεν φεύγει: Πώς το μαγνήσιο και η βιταμίνη Β12 μπορούν να αναζωογονήσουν τον οργανισμό
ΔΕΙΤΕ ΕΠΙΣΗΣ | Η EFSA αξιολογεί το έλαιο δενδρολίβανου ως ασφαλές πρόσθετο στις ζωοτροφές
Σύμφωνα με τη μελέτη, που δημοσιεύθηκε στο Journal of Food Protection, το Campylobacter παραμένει η κύρια αιτία τροφιμογενών λοιμώξεων στις Ηνωμένες Πολιτείες από το 2014, με το κοτόπουλο να αποτελεί τη βασική πηγή μετάδοσης. Για να εκτιμήσουν τα πραγματικά επίπεδα μόλυνσης, οι ερευνητές συνέλεξαν 209 δείγματα στήθους κοτόπουλου χωρίς δέρμα και κόκαλα από επτά παντοπωλεία στην πόλη State College της Πενσυλβάνια, μεταξύ Οκτωβρίου 2023 και Ιουλίου 2024. Τα δείγματα προέρχονταν από εγκαταστάσεις επεξεργασίας σε τουλάχιστον οκτώ διαφορετικές πολιτείες.
Ευρήματα και μέθοδοι ανίχνευσης
Με χρήση καλλιεργειών εμπλουτισμού και ποιοτικής αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης (qPCR), οι ερευνητές εντόπισαν Campylobacter σε μόλις 1,9% των δειγμάτων. Από τα 209 δείγματα, 15 (7,2%) παρήγαγαν ορατές αποικίες, ενώ η αλληλούχιση ολόκληρου γονιδιώματος (WGS) επιβεβαίωσε τέσσερα στελέχη ως Campylobacter jejuni.
ΔΕΙΤΕ ΕΠΙΣΗΣ | Πρωτοποριακή δοκιμή με τεχνητή νοημοσύνη ελέγχει διαφημίσεις αλκοόλ για τήρηση κανόνων
ΔΕΙΤΕ ΕΠΙΣΗΣ | Πάνω από 350.000 πολίτες απαιτούν νόμο που θα απαγορεύει την ασπαρτάμη στην Ευρωπαϊκή Ένωση
Τα στελέχη αυτά προέρχονταν από κοτόπουλο που είχε επεξεργαστεί στην Πενσυλβάνια, το Ιλινόις, τη Βιρτζίνια και το Ντελαγουέρ, και αντιπροσώπευαν νέους τύπους αλληλουχίας που δεν είχαν εντοπιστεί προηγουμένως.
Η μέθοδος εμπλουτισμού αποδείχθηκε η πιο ευαίσθητη, με δυνατότητα ανίχνευσης μόλις 12 κυττάρων ανά 325 γραμμάρια κρέατος, έναντι 60 CFU/325 g για την άμεση καλλιέργεια και 3.200–5.000 κυττάρων/325 g για την qPCR βιωσιμότητας. Ωστόσο, οι ερευνητές επισημαίνουν ότι ο εμπλουτισμός είναι επιρρεπής σε παρεμβολές από ανταγωνιστικά μικρόβια, κάτι που καθιστά απαραίτητη την ενσωμάτωση επιλεκτικών συμπληρωμάτων για την καλύτερη ανάκτηση του βακτηρίου.
ΔΕΙΤΕ ΕΠΙΣΗΣ | LIDL Fr: Ανακαλείται τρόφιμο μεγάλης ζήτησης από 200 σουπερμάρκετ – Είναι μολυσμένο
ΔΕΙΤΕ ΕΠΙΣΗΣ | Νέοι κανόνες του ΕΦΕΤ για τα αυγά: Αυστηρότερες απαιτήσεις στη σήμανση, τέλος στις ασαφείς ετικέτες και τις καθυστερήσεις
Η γονιδιωματική ανάλυση αποκάλυψε γονίδια αντοχής σε αντιμικροβιακά που σχετίζονται με την αμπικιλλίνη και την τετρακυκλίνη σε τρία από τα τέσσερα στελέχη, χωρίς ωστόσο να εντοπιστεί αντοχή σε φθοροκινολόνες ή μακρολίδες. Παρά τη χαμηλή επικράτηση, τα ευρήματα αναδεικνύουν τη σημασία ευαίσθητων τεχνικών ανίχνευσης και εκτεταμένης γονιδιωματικής επιτήρησης, ώστε να κατανοηθούν καλύτερα οι πηγές και οι μηχανισμοί μόλυνσης του Campylobacter. Οι επιστήμονες τονίζουν ότι τα συστήματα επιτήρησης πρέπει να εμπλουτιστούν με νέα δεδομένα για να αντικατοπτρίζουν τη συνεχή εξέλιξη του βακτηρίου.
Προοπτικές
Η ερευνητική ομάδα σχεδιάζει περαιτέρω συγκρίσεις ανάμεσα σε διαφορετικά μέσα εμπλουτισμού, με στόχο την βελτιστοποίηση της ανάκτησης του Campylobacter από πολύπλοκα δείγματα. Η μελέτη χρηματοδοτήθηκε εν μέρει από το Εθνικό Ινστιτούτο Τροφίμων και Γεωργίας και το Υπουργείο Γεωργίας των ΗΠΑ (USDA), στο πλαίσιο του προγράμματος Hatch Appropriations.
ΔΕΙΤΕ ΕΠΙΣΗΣ | Τρία ελαιόλαδα διαφορετικών εταιρειών αποσύρονται μετά από υποβάθμιση ποιότητας – Δείτε μάρκες και εταιρείες
ΔΕΙΤΕ ΕΠΙΣΗΣ | Μπισκότα και κουλούρια: πόσο επηρεάζουν πραγματικά την καρδιά μας; Μελέτη του King’s College London και του Maastricht
Η εργασία αυτή επιβεβαιώνει ότι, αν και το Campylobacter εντοπίζεται σπάνια στο εμπορικό κοτόπουλο, η μικροβιακή του ποικιλομορφία και η αναδυόμενη αντοχή του καθιστούν αναγκαία τη συνεχή επιστημονική παρακολούθηση.
